Βρίσκεται στη βόρεια πλευρά της Κέρκυρας, στον δήμο Θιναλίων, λίγο μετά την παραλία του Αλμυρού και του Άγιου Σπυρίδωνα Περίθειας. Η έκτασή της αγγίζει περίπου τα 400 στρέμματα, ενώ ανήκει σε ένα μοναδικό σύμπλεγμα υδροβιότοπου, το οποίο αποτελείται από το έλος Κουνουφάδι, που αγγίζει τα 590 στρέμματα και την κύρια έκταση της λιμνοθάλασσας Αντινιώτη που είναι γνωστή για τα σπάνια υδρόβια φυτά της και τον περίγυρό της που είναι γεμάτος από μοναδικά αγριολούλουδα.

Στην επιφάνειά της πλέουν πολύχρωμες ορχιδέες και κρίνοι, εξού και η Λιμνοθάλασσα Αντινιώτη ονομάζεται από άλλους ως λίμνη των ορχιδέων ή λίμνη των κρίνων.

Σύμφωνα με τους υδροβιολόγους, στην περιοχή αναπτύσσονται περισσότερα από 16 διαφορετικά είδη ορχιδέας και σπάνια είδη όπως είναι οι Opphrys, Orchis και Serapias, που χαρακτηρίζονται όχι μόνο από ομορφιά, αλλά και από ενδιαφέρουσα βιολογία.

Η Λιμνοθάλασσα Αντινιώτη θεωρείται ένα από τα πιο εντυπωσιακά τοπία στην Κέρκυρα, με αρκετά πολυποίκιλο οικοσύστημα, όπου βρίσκουν καταφύγιο πολλά είδη ενδημικών και αποδημητικών σπανίων πουλιών, με τους επιστήμονες να καταγράφουν περισσότερα από 90 είδη.

Η βιοποικιλότητα αυτού του τόπου έχει ιδιαίτερο ενδιαφέρον λόγω της ύπαρξης μιας μοναδικής ορνιθοπανίδας η οποία περιλαμβάνει απειλούμενα υδρόβια και παρυδάτια καθώς και αρπακτικά είδη.

Οι τελματοχελώνες της λιμνοθάλασσας ανήκουν στις οικογένειες Emys orbicularis και Mauremys caspica και είναι σημαντικά πανιδικά στοιχεία, των υγροτόπων της Μεσογείου.

Το πιο σπάνιο είδος της λιμνοθάλασσας είναι η βίδρα ή σβίδρα, (Lutra lutra) η οποία ζει σε μικρούς πληθυσμούς παράκτια της λίμνης και είναι ένα από τα προστατευόμενα είδη της λιμνοθάλασσας. Η ευρασιατική βίδρα θεωρείται από τα σπανιότερα και πιο απειλούμενα θηλαστικά της Ευρώπης.

Η ιχθυοκαλλιέργεια στη λιμνοθάλασσα είναι εκτατικής μορφής , δηλαδή στηρίζεται στο βιολογικό φαινόμενο της διαχρονικής μετανάστευσης ορισμένων ειδών από τη θάλασσα και αντίστροφα. Τα κυριότερα είδη ψαριών που αλιεύονται είναι χέλια, κεφαλοειδή, τσιπούρες, λαβράκια και σαργοί

Στη λίμνη ζουν και σπάνια είδη ψαριών όπως τα ψάρια Valencia hispanica και Aphanius fasciatus, αλλά και το ψάρι Knipowitschia goerneri που είναι ένα απειλούμενο είδος, ενδημικό της Κέρκυρας.

Η λιμνοθάλασσα Αντινιώτη προστατεύεται από τη συνθήκη Natura 2000, ενώ πολλά από τα είδη που αναπτύσσονται στην περιοχή προστατεύονται και από τη Συνθήκη της Βέρνης, ωστόσο συχνές είναι οι καταγγελίες των τοπικών παραγόντων για την αδιαφορία κυρίως των κυνηγών.

Η λιμνοθάλασσα Αντινιώτη προσελκύει τους τουρίστες, κυρίως κατά τους θερινούς μήνες, ενώ αποτελούσε το αγαπημένο μέρος της γνωστής βρετανικής οικογένειας Ντάρελς. Εκεί περνούσε τα καλοκαίρια του ο νεαρός τότε Τζέρι Ντάρελ, μανιώδης φιλόζωος και φυσιολάτρης για να γίνει αργότερα ένας από τους πιο σημαντικούς μελετητές και ένθερμος υποστηρικτής των άγριων ζώων, ιδρύοντας το Κέντρο Προστασίας Άγριας Ζωής στο Τζέρσεϊ. Τις μνήμες του από την Κέρκυρα και τη λιμνοθάλασσα Αντινιώτη, ο Τζέρι Ντάρελ τις μετέφερε σε δύο συναρπαστικά βιβλία, «Η οικογένειά μου και άλλα ζώα» και «Ζώα, πουλιά και συγγενείς». Τα βιβλία του σημείωσαν τεράστια παγκόσμια επιτυχία, ενώ ο ίδιος χαρακτηρίστηκε ως «λογοτεχνική ιδιοφυΐα».